Konfigurace Apache HTTP Serveru se nachází v adresáři `/etc/apache2/`. Konfigurace *virtualhostů* jednotlivých subdomén je pak v podadresáři `/etc/apache2/sites-available/`, resp. `/etc/apache2/sites-enabled/`. Každý jednotlivý konfigurační soubor se týká pouze jednoho virtualhosta, resp. jedné subdomény. V případě webů běžících přímo na doméně druhého řádu jsou tyto vždy zároveň aliasovány i subdoménou `www` ve stejném konfiguračním souboru. Všechny virtualhosty mají nastaveno automatické přesměrovávání HTTP na HTTPS, včetně zaslání HTTP Strict Transport Security (HSTS) hlavičky.
Stejné rozdělení domén a subdomén je pak použito i u Let's Encrypt certifikátů o které žádá ACME klient [acme.sh](https://acme.sh/), jehož konfigurační adresář je `/etc/acme-sh`. Klient acme.sh má nastavenou cron úlohu pro automatickou obnovu certifikátů, která je spouštěna každý den ve 22:22.
V hlavním konfiguračním souboru Apache `/etc/apache2/apache2.conf` je nastavena výjimka pro URL `/.well-known/acme-challenge`, na které ACME protokol provádí challenge-response autentizaci. Tato lokace je tedy vždy vyjmuta z virtualhostů a aplikací na nich běžících a je spravována přímo globální konfigurací Apache.
Apache server neposílá hlavičku s informací o verzi. OpenSSL je nastaveno pro podporu moderních a mainstreamově používaných protokolů a šifer následnovně:
Výsledek Qualys SSL testu: [SSL_Server_Test__server.spotter.cz__Powered_by_Qualys_SSL_Labs_.pdf](uploads/bdab2d085a4538d5c0ad977a90493490/SSL_Server_Test__server.spotter.cz__Powered_by_Qualys_SSL_Labs_.pdf)
PHP 7.2 interpret běží v samostatném manažeru procesů PHP-FPM a nesdílí tak paměťový prostor Apache HTTP Serveru, jako by tomu bylo v *tradičním* nastavení s mod_php7. Apache HTTP Server komunikuje s PHP-FPM přes FastCGI rozhraní zprostředkované pomocí *mod_proxy_fcgi* a unixových socketů v adresáři `/run/php/`. Hlavní konfigurační soubor pro PHP-FPM je `/etc/php/7.2/fpm/php.ini` a jednotlivé fondy procesů jsou definovány konfiguračními soubory v `/etc/php/7.2/fpm/pool.d/`. V současnosti je zde nastaven jen jediný fond s názvem `www` a 16 dynamicky vytvářenými PHP procesy.
PHP neposílá hlavičku s informací o verzi. Funkce spouštění externích procesů jsou zakázány. Odesílání mailů funkcí `mail()` a jejími deriváty je logováno do souboru `/var/log/phpmail.log`.